免疫球蛋白(抗体的学术名称，两词常可互相替换)是一异质四聚体的球形分子，系由两对藉双硫键联接的重链与轻链所构成。在胎生哺乳动物中，免疫球蛋白的重链部份根据序列可区分为IgM (μ)、IgD (δ)、IgG (γ)、IgA (α)、IgE (ε)等五种亚型，于不同的物种有时更存在「次亚型」，例如人类的的IgG有四种次亚型：IgG1 (γ1)、IgG2 (γ2)、IgG3 (γ3)与IgG4 (γ4)，小鼠的IgG有IgG1 (γ1)、IgG2a (γ2a)、IgG2b (γ2b)、IgG3 (γ3)等次亚型。轻链部份则可分为κ和λ两种亚型。除了以序列为区分的亚型，根据蛋白质的结构功能，抗体亦能区分为：抗原结合区和可结晶区两个区块。

一般而言一抗多为IgG抗体，而多株的IgG二抗通常可辨认到所有亚型的重链及轻链，故二抗使用可辨认宿主IgG抗体即可；或者也可以根据一抗的亚型使用特定亚型的二抗。例如：一抗为小鼠 IgG2a 抗体时，可使用抗小鼠IgG或抗小鼠IgG2a的二抗。